Prendre la pilule contraceptive peut affecter les valeurs de cholestérol sanguin. Le poids de cet effet dépend du type de contraceptif utilisé, plus particulièrement de la concentration en œstrogènes et en progestatifs. Les œstrogènes contenus dans les pilules contraceptives semblent augmenter légèrement les niveaux de bon cholestérol (HDL), tout en diminuant le mauvais (LDL); le résultat final est une légère augmentation du cholestérol total, accompagnée d'une augmentation significative des triglycérides. Les progestatifs contenus dans les pilules contraceptives auraient un effet opposé, étant donné la tendance à augmenter le cholestérol LDL en diminuant la part de HDL.