Acides aminés ordinaires et synthèse protéique
Les acides aminés qui apparaissent le plus fréquemment dans les structures protéiques des organismes vivants sont appelés acides aminés ordinaires ou protéagènes. Bien que nous connaissions plus de 500 types d’acides aminés dans la nature, nous n’avons que vingt personnes ordinaires. A côté de ceux-ci, il en existe des plus rares, appelés occasionnels, qui dérivent généralement du métabolisme des métabolites ordinaires après leur incorporation dans la chaîne protéique. Dans le collagène, par exemple, la lysine et la proline, deux acides aminés ordinaires, se trouvent sous la forme hydroxylée (hydroxyproline et hydroxylisine).
La plupart des autres acides aminés non ordinaires sont principalement composés d'enzymes et d'hormones de type protéique, ou de meilleur peptide (rappelez-vous que pour être considérée comme telle, une protéine doit être composée de plus de 100 acides aminés, tout en formant un oligo et un polypeptide est suffisant de 2 à 9 et de 10 à 100).
Parmi les 20 acides aminés ordinaires, nous nous souvenons
Alanine, Arginine, Asparagine, Acide Aspartique, Cystéine, Glycine, Acide Glutamique, Glutamine, Histidine, Isoleucine, Leucine, Lysine, Méthionine, Phénylalanine, Proline, Sérine, Thréonine, Tréonine, Tryptophane, Tyrosine, Valine
Des exemples d'acides aminés non ordinaires sont:
la carnitine (impliquée dans le transport des acides gras à longue chaîne dans la mitochondrie, où ils sont utilisés pour produire de l'énergie);
l'ornithine, la citrulline et l'homocystéine (ils participent au métabolisme des acides aminés - cycle de l'urée);
hydroxyproline et hydroxylisine (comprises dans la composition du collagène et de certaines protéines);
sarcosine (ou méthylglycine).
Certains acides aminés peuvent également avoir une importance commerciale ou pharmacologique.
- Le glutamate de sodium est utilisé dans l'industrie alimentaire comme exhausteur de goût (voir le cube de bouillon).
- La L-dihydroxyphénylalanine (L-DOPA) est un médicament utilisé pour traiter la maladie de Parkinson.
- Le 5-hydroxytryptophane (5-HTP) a été utilisé pour le traitement des symptômes neurologiques associés à la phénylcétonurie (une maladie métabolique héréditaire qui empêche l'utilisation de la phénylalanine, un acide aminé essentiel, en raison de déficiences enzymatiques particulières, l'accumulation de phénylalanine. dans les tissus, il est responsable de lésions graves au niveau cutané et neurologique).
Les plantes et les bactéries sont capables de produire des acides aminés particuliers, que l'on retrouve dans les antibiotiques peptidiques, tels que la nisine et l'alaméthicine.
Acides aminés essentiels
Certains des 20 acides aminés ordinaires sont appelés essentiels, car ils ne peuvent pas être synthétisés par l'organisme à partir d'autres composés, mais doivent être pris avec des aliments.
Pour les humains, il s'agit de phénylalanine, leucine, isoleucine, lysine, méthionine, thréonine, tryptophane, valine et, chez l'enfant, d'histidine et d'arginine.
Acides aminés ordinaires, caractéristiques chimiques
Sur la base des caractéristiques chimiques du radical R (groupe d'atomes formant une chaîne pas très longue), les acides aminés peuvent être divisés en plusieurs catégories.
Acides aminés avec R apolaire (incapable de former des liaisons hydrogène):
à chaîne aliphatique: alanine, leucine, isoleucine, valine, proline
à chaîne aromatique: phénylalanine, tryptophane
avec une chaîne contenant un atome de soufre: méthionine
Acides aminés avec R polaire:
avec groupe OH: sérine, thréonine, tyrosine
avec le groupe SH: la cystéine
avec groupe CO-NH 2 : asparagine, glutamine
avec H: glycine (le seul acide aminé non chiral)
Acides aminés avec R basique:
lysine, arginine, histidine
Acides aminés avec l'acide R:
acide glutamique, acide aspartique
