La flore intestinale dite putréfiante a la capacité de digérer les protéines et les petits peptides échappant à la digestion et à l'absorption entérique.
Sans décomposition, la pourriture est le processus de décomposition des protéines. Le fait qu'un régime riche en protéines favorise le développement d'une flore bactérienne intestinale à prédominance putréfiante n'est pas accidentel.
Les problèmes proviennent du fait que, à partir de protéines, ces bactéries produisent différentes substances (amines, ammoniac, phénols, indoles); parmi ceux-ci, certains (en particulier les amines) donnent à la flatulence une odeur désagréable (par exemple, la putrescine et la cadavérine), tandis que d'autres sont particulièrement toxiques, voire cancérogènes.
Il suffit de penser aux réactions de nitrosation pouvant générer des composés cancérigènes, tels que les nitro-amines. Cela expliquerait pourquoi une alimentation riche en viande et pauvre en fruits et légumes est liée à un risque accru de cancer colorectal.
