L'iridologie est née en Hongrie à la fin du 19ème siècle, mais l'observation de l'œil était déjà très ancienne dans un sens diagnostique.
En médecine traditionnelle chinoise, par exemple, l'étude des différents domaines de l'iris et de la sclérotique correspondait aux éléments constitutifs de l'homme selon les principes de l'acupuncture.
L'iridologie moderne est née avec le médecin homéopathique hongrois Ignazio Von Peczely, dont les recherches découlent d' observations personnelles, dont certaines remontent à son enfance.
Une anecdote rapporte que Von Peczely, à l'âge de onze ans, a capturé un hibou dans la cour arrière, ce qui lui a cassé la patte pour tenter de s'échapper. Le jeune Hongrois a remarqué la formation d’une tache dans l’iris, à la pointe de la jambe dans le schéma topographique de l’iris.
Ce signe frappa beaucoup Von Peczely, qui, après quelque temps, remarqua un phénomène similaire dans un « iris humain » et, grâce à ses études en médecine, publia en 1880 le texte " Introduction à l’étude du diagnostic par les yeux " et en 1886, la première topographie de l'iris.
