La fièvre jaune est une maladie endémique en Amérique et en Afrique, entre le 15ème parallèle nord et le 10ème parallèle sud.
L'incidence est plus élevée dans les zones de savane d'Afrique centrale et occidentale, durant la dernière phase de la saison des pluies et la phase initiale de la saison sèche, avec des épidémies occasionnelles dans les zones urbaines et dans les villages. L'Organisation mondiale de la santé estime que 200 000 cas par an surviennent sur le continent africain.
Par contre, en Amérique centrale et en Amérique du Sud, certaines régions équatoriales et tropicales sont endémiques: les épisodes sont sporadiques (ils seraient de 100 à 200 cas par an) et se produisent principalement pendant la saison où le pic de précipitations est enregistré; très rares sont les cas de touristes infectés.
