Le diagnostic de fièvre jaune n’est pas simple, le tableau clinique pouvant présenter une symptomatologie difficile à distinguer de celle des autres fièvres hémorragiques virales, paludisme, fièvre typhoïde, leptospirose, dengue et hépatite.
La fièvre jaune doit donc être suspectée chez les patients d'une zone d'endémie qui développent une fièvre soudaine avec bradycardie et jaunisse. Des tests de laboratoire effectués immédiatement dans un hôpital qualifié permettront de confirmer ou d'exclure le diagnostic.
Les enquêtes utiles à cet effet comprennent la numération sanguine, l'analyse d'urine, les tests de la fonction hépatique, les cultures cellulaires et la rétrotranscription avec la réaction en chaîne de la polymérase (RT-PCR). La confirmation du diagnostic est fournie par la présence d'anticorps spécifiques détectés par des tests sérologiques, tels que le test ELISA (dosage immuno-enzymatique).
